L'anime si basa su dei personaggi particolari: i cacciatori, sono coloro che dedicano la propria vita nella ricerca di tesori nascosti, mostri e demoni spaventosi. Il mestiere di cacciatore puo dare accesso a risorse pressoche inesauribili, sia a livello economico che a livello di informazioni e supporto. I cacciatori per essere cosi devono essere molto coraggiosi, forti e devono superare moltissime prove per aggiudicarsi l'ambizioso titolo che gli verra riconosciuto da un organizzazione apposita che li valuta tramite un difficilissimo esame dove solo poche persone, sulle migliaia che ci provano ogni anno, riescono. Protagonista del anime è
Gon, un giovane ragazzo che vive con sua zia e sua nonna, visto che la madre era morta e il padre, Gin, era fuggito inseguendo il suo sogno: diventare un Hunter. Per questo motivo anche Gon decide di diventare un cacciatore seguendo cosi le prestigiose orme del padre e sperando di incontrarlo un giorno. Dopo molte prove, la zia lascera partire il piccolo nipote per andare a fare l'esame, durante il quale lui incontra parecchi amici:
Leorio,
Kurapica e
Killua, discendente di una famiglia di assassini da cui si vuole distaccare, ma anche nemici, come il potente e temibile
Hisoka. In seguito i ragazzi per aumentare molto i loro poteri imparano la particolare pratica del Nen e da allora in poi, i nostri eroi si cimenteranno in fantastiche avventure e numerosi intrighi.